تفاوت در رابطه با استفاده از حسابرسی داخلی و مستقل
حسابرسی مستقل: معمولاً یک ضرورت قانونی است و مدیریت سازمان آن را بوجود نمی آورد. ولی حسابرسی داخلی ارزیابی مستقلی است که توسط مدیران سازمان ( احتمالاً در اجرای یک الزام قانونی ) بوجود می آید.
تفاوت از نظر هدف های اصلی
هدف اصلی حسابرسی مستقل، اظهار نظر در این مورد است که، صورتهای مالی به درستی تنظیم شده است. و وضعیت سازمان را به نحوی مطلوب نشان میدهد. و دارای اشتباه و تحریف با اهمیت نیست. هدف اصلی حسابرسی داخلی بررسی تمامی سیستم کنترل داخلی میباشد .